為提供具公信力檢測成績，教育部已在全台設置50所體適能檢測站。11個採計體適能成績的就學區中，桃園、雲林等2區僅採認學校自行檢測成績，台南、彰化、屏東等3區僅採用檢測站成績，高雄、嘉義等6區同時採認學校或檢測站的成績。基北、竹苗、中投和台東區不採認適體能成績。
體適能檢測包括肌耐力（1分鐘屈膝仰臥起坐）、柔軟度（坐姿體前彎）、瞬發力（立定跳遠）及心肺耐力（女生800、男生1600公尺跑走）等4項。以14歲國二學生為例，女生仰臥起坐1分鐘達22下、男生達30下，即可通過。
教育部體育署科長蔡惠如表示，為避免學生家長疑慮或陷入補習迷思，以簡化、從優及設定採計門檻原則記分，學生4項檢測項目中，只要任2項達25%的常模等級（得分在每百人中，高過25人），就視為通過門檻，對一般學生來說並不難。
身心障礙學生或持有公立醫院證明為重大傷病、體弱學生，不需要檢測，同樣可拿到體適能分數。
學生可透過檢測站或學校取得體適能檢測成績證明，各區檢測站3到5月或10到12月期間內都可報名檢測，完全免費；或可由學校自行檢測並上傳證明，再由學生登錄健康體育網路護照列印證明，經學校核章後使用。
蔡惠如表示，學生只要3年內有1次檢測達到標準，就算通過，不限檢測次數。根據教育部99年施測結果，學生通過門檻比率為86%，仍有1成4無法通過。
目前11個採計體適能成績的就學區中，桃園和高雄採門檻方式計分。彰化、台南等9區，採門檻及金銀銅質獎加分方式併行。金質獎為在全體學生中排名前15%，加2分；銀質獎為前25%，加1分；銅質獎為前50%，加0.5分。
各就學區體適能檢測站報名梯次、聯絡電話均已公布在教育部體育署體適能網站（http://www.fitness.org.tw/），學生可多加利用。
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